Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCP20941 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCP20941 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCP20941 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCP20941 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms