Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DPA1P20036 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms