Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMY2BP19961 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms