Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms