Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms