Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HKR1P10072 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HKR1P10072 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HKR1P10072 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HKR1P10072 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HKR1P10072 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HKR1P10072 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HKR1P10072 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HKR1P10072 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HKR1P10072 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HKR1P10072 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HKR1P10072 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms