Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms