Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms