Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC159P0C7I6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms