Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y9

H2AFB1, Histone H2A-Bbd type 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB1P0C5Y9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFB1P0C5Y9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2AFB1P0C5Y9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms