Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms