Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NGFRP08138 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms