Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-7P01780 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-7P01780 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms