Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGFRP00533 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGFRP00533 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGFRP00533 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EGFRP00533 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGFRP00533 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EGFRP00533 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGFRP00533 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms