Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEC24DO94855 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEC24DO94855 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEC24DO94855 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEC24DO94855 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEC24DO94855 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEC24DO94855 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEC24DO94855 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24DO94855 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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