Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN5O75503 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN5O75503 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms