Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms