Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND1O60716 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms