Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GMDSO60547 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GMDSO60547 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GMDSO60547 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms