Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms