Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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