Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms