Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNQ3O43525 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms