Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBDO15205 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBDO15205 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBDO15205 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBDO15205 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBDO15205 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms