Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3AO14802 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3AO14802 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms