Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL2C9JE40 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms