Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DGG1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DGG1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DGG1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DGG1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DGG1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DGG1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DGG1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DGG1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DGG1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DGG1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DGG1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DGG1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DGG1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
B4DGG1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
B4DGG1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DGG1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms