Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BECN2A8MW95 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN2A8MW95 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN2A8MW95 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN2A8MW95 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms