Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms