Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms