Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms