Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC4A6NH21 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms