Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFAP73A6NFT4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFAP73A6NFT4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFAP73A6NFT4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms