Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms