Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms