Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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