Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms