Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms