Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP15Q9Y4E8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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