Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
DCAF1Q9Y4B6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms