Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NFE2L3Q9Y4A8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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NFE2L3Q9Y4A8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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NFE2L3Q9Y4A8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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NFE2L3Q9Y4A8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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NFE2L3Q9Y4A8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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