Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms