Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms