Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF3AQ9Y2N7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms