Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms