Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS5Q9UPZ3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms