Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms