Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPCN1Q9ULQ1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPCN1Q9ULQ1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms