Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C4Q9UKN8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms