Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2IRD1Q9UHL9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2IRD1Q9UHL9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2IRD1Q9UHL9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2IRD1Q9UHL9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2IRD1Q9UHL9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2IRD1Q9UHL9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2IRD1Q9UHL9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2IRD1Q9UHL9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2IRD1Q9UHL9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GTF2IRD1Q9UHL9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms